Bioinformatique structurale

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  • Rêves de recherche, rêve de chercheurs  
    Rêves de recherche, rêve de chercheurs
    49004
    Interview Bruno Villoutreix, directeur de l'unité Inserm 973 "Recherche de Molécules à visée Thérapeutique par approches in silico", Université Paris Diderot. Candidats médicaments : "Il faut que la molécule ait tout un tas de propriétés et qu'elle puisse être administrée chez l'homme, qu'elle ne soit pas toxique etc..." Extrait d'une collection de films courts, coproduite par l'Inserm et Cargo Films, Jean-Jacques Beineix, 2009-2010. Durée: 2min. 27 sec.
    15/12/2010
    Inserm/Cargo Films

      Inserm/Cargo Films

  • Le criblage virtuel in silico
    Le criblage virtuel in silico
    52298
    Le criblage virtuel in silico, une approche chemoinformatique qui dans le cas présent (il y a d'autres méthodes de criblage virtuel qui n'utilisent pas la structure des cibles thérapeutiques) vise à placer des millions de petites molécules chimiques dans une petite cavité présente à la surface d'une protéine impliquée dans une pathologie. Certaines de ces petites molécules vont pouvoir bloquer notre protéine, du moins, en théorie, suite à une série de calculs et seront alors achetées et testées in vitro. Certaines de ces petites molécules pourront servir de base au développement de nouveaux médicaments. L'avantage de cette approche in silico est donc de fournir une petite liste de molécules à tester expérimentalement et ainsi réduire les couts et gagner du temps. On peut aussi explorer rapidement de nombreuses pistes pour se focaliser ensuite, au niveau expérimental, sur les molécules les plus intéressantes. On comprend facilement que ces approches in silico ne sont pas parfaites à cause des mécanismes complexes qui doivent être simulés par l'ordinateur mais que cribler expérimentalement une liste de 1000 molécules issues d'un criblage silico est beaucoup moins onéreux (environ 5000 euros) que de cribler 1 million de molécules (environ 200000-500000 euros) !
    08/11/2011
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Protéine
    Protéine
    52300
    Identification d"une nouvelle poche capable de fixer une petite molécule chimique sur la protéine SYK (spleen tyrosine kinase, sur la gauche). Cette protéine est impliquée dans la progression des cancers, les maladies auto-immunes et les allergies.
    08/11/2011
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle du protéasome
    Structure tridimensionnelle du protéasome
    52301
    Structure expérimentale du protéasome (surface solide) avec un anticancéreux, le Velcade, co-cristallisé dans le site catalytique ou positionné par des calculs théoriques pour calibrer des travaux de criblage virtuel et de chemoinformatique dans le but d'identifier des nouveaux inhibiteurs aussi efficaces mais entrainants moins d'effets secondaires.
    08/11/2011
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle de 2 unités du protéasome complexée avec le bortézomib
    Structure tridimensionnelle de 2 unités du protéasome complexée avec le bortézomib
    58982
    Le bortézomib ou velcade, est une petite molécule anticancéreuse. Les premières études cliniques du bortézomib ont concerné le myélome multiple.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Modélisation du complexe prothrombinase
    Modélisation du complexe prothrombinase
    52299
    Modélisation du complexe facteur Va en rose et facteur Xa en vert. La formation du complexe prothrombinase (facteur Va, facteur Xa, prothrombine, absente dans cette figure) à la surface de certaines cellules est essentielle pour générer la thrombine, une protéine clef de la coagulation sanguine.
    08/11/2011
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle du facteur Xa de la coagulation sanguine avec le rivaroxaban
    Structure tridimensionnelle du facteur Xa de la coagulation sanguine avec le rivaroxaban
    58973
    Structure tridimensionnelle du facteur Xa de la coagulation sanguine (sérine protéase) avec le rivaroxaban dans le site catalytique. Le rivaroxaban est un anticoagulant oral commercialisé sous le nom de Xarelto.
    02/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle du rivaroxaban
    Structure tridimensionnelle du rivaroxaban
    58969
    Structure tridimensionnelle du rivaroxaban (xarelto TM), un antithrombotique (anticoagulant oral) qui bloque le site catalytique d'une sérine protéase, le facteur Xa de la coagulation sanguine.
    02/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure du salbutamol
    Structure du salbutamol
    58984
    Le salbutamol (Ventoline) est un bronchodilatateur utilisé pour soulager les bronchospasmes dans des états tels que l'asthme et les broncho-pneumopathies chroniques.
    04/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle du Montélukast
    Structure tridimensionnelle du Montélukast
    61531
    Structure 3D du Montélukast, principe actif du Singulair, indiqué dans certains cas pour le traitement de l'asthme.
    02/05/2016
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle de la HMG-CoA réductase complexée avec une statine
    Structure tridimensionnelle de la HMG-CoA réductase complexée avec une statine
    58986
    Structure de la HMG-CoA réductase complexée avec une statine (l'atorvastatine ou Lipitor), une classe d'hypolipidémiants, utilisé comme médicament pour baisser la cholestérolémie.
    04/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle du complexe aliskirène - rénine
    Structure tridimensionnelle du complexe aliskirène - rénine
    58970
    L'aliskirène (ou Rasilez ™ - traitement de l'hypertension artérielle essentielle) est un inhibiteur direct de la rénine humaine, non peptidique, sélectif et actif par voie orale. Il bloque l'action de la rénine afin de diminuer la production d'angiotensine II. L'angiotensine II est une substance responsable de la contraction des artères, ce qui augmente la tension artérielle et fatigue le coeur. Les petites sphères rouges autour de l'aliskirène représentent des molécules d'eau.
    02/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle du complexe aliskirène - rénine
    Structure tridimensionnelle du complexe aliskirène - rénine
    58971
    L'aliskirène (ou Rasilez ™ - traitement de l'hypertension artérielle essentielle) est un inhibiteur direct de la rénine humaine, non peptidique, sélectif et actif par voie orale. Il bloque l'action de la rénine afin de diminuer la production d'angiotensine II. L'angiotensine II est une substance responsable de la contraction des artères, ce qui augmente la tension artérielle et fatigue le coeur. Les petites sphères rouges autour de l'aliskirène représentent des molécules d'eau.
    02/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle d'un fragment d'ADN
    Structure tridimensionnelle d'un fragment d'ADN
    58983
    L'ADN est la molécule de l'hérédité qui forme les chromosomes et qui contient l'ensemble des gènes. Chaque gène est un bout d'ADN qui contient, sous forme codée, toute l'information relative à la vie d'un organisme vivant.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Structure tridimensionnelle d'un canal ionique
    Structure tridimensionnelle d'un canal ionique
    58981
    Les ions sont représentés par des petites sphères. Une simulation bioinformatique (ligne violette) montre le chemin que devrait suivre les ions pour passer rapidement de l'autre coté d'une membrane.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle du complexe FSH-FSHR
    Structure tridimensionnelle du complexe FSH-FSHR
    58980
    La FSH "follicle-stimulating hormone" est un acteur clé en reproduction humaine, elle active son récepteur, le FSHR "Follicle Stimulating Hormone Receptor". Mais le FSHR est un marqueur tumoral bien plus répandu que prévu. Pouvoir l'identifier devrait aider à mieux reconnaitre et traiter les cancers.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure de l'aspirine
    Structure de l'aspirine
    58976
    L'acide acétylsalicylique, plus connu sous le nom d'aspirine, est la substance active de nombreux médicaments qui réduisent la douleur, la fièvre et l'inflammation. Il est aussi utilisé comme antiagrégant plaquettaire. Il s'agit d'un anti-inflammatoire non stéroïdien.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

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  • Anti-inflammatoires non stéroïdiens
    Anti-inflammatoires non stéroïdiens
    58974
    Trois anti-inflammatoires non stéroïdiens, de gauche à droite : aspirine, naproxène et ibuprofène.
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle de la Cox-1 complexée avec l'ibuprofène
    Structure tridimensionnelle de la Cox-1 complexée avec l'ibuprofène
    58975
    Structure tridimensionnelle de la Cox-1 (cyclo-oxygénase) complexée avec l'ibuprofène (anti-inflammatoire non stéroïdien).
    03/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure d'une thymidine kinase virale co-cristallisée avec l'aciclovir
    Structure d'une thymidine kinase virale co-cristallisée avec l'aciclovir
    58972
    Structure d'une thymidine kinase virale co-cristallisée avec l'aciclovir. L'aciclovir ou acyclovir commercialisé sous les noms de Zovirax, Activir ou Aciclovir, est l'un des principaux médicaments antiviraux.
    02/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure tridimensionnelle de la dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) complexée avec la sitagliptine
    Structure tridimensionnelle de la dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) complexée avec la sitagliptine
    58985
    La sitagliptine (Januvia ™) est une molécule antidiabétique. La sitagliptine appartient à une classe d'hypoglycémiants oraux appelés inhibiteurs de la dipeptidylpeptidase-4 (DPP-4).
    04/12/2014
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure de la metformine
    Structure de la metformine
    59473
    La metformine (Glucophage TM) est un antidiabétique oral. A gauche, la surface moléculaire d'une structure en trois dimensions théorique de la metformine. A droite, la structure en deux dimensions.
    15/02/2015
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno

  • Structure du glipizide
    Structure du glipizide
    59474
    Le glipizide (Glucotrol TM aux USA) est utilisé dans la prise en charge du diabète de type 2, administration par voie orale. Le glipizide est un sulfonylurée de seconde génération (identifié autour de 1970). A gauche: la surface moléculaire de la structure en trois dimensions. A droite, la structure en deux dimensions.
    16/02/2015
    Inserm/Villoutreix, Bruno

    Inserm/Villoutreix, Bruno